Jadi, untuk menentukan sifat fisikokimia dari suatu ligan itu kan harus melakukan uji Lipinski dengan syarat berat molekul <500 Da, nah kalo berat molekul nya >500 Da itu sulit untuk menembus membran sel, nah bagaimana cara untuk menurunkan berat dari molekul tersebut, apakah molekul tersebut bisa tetap masuk kedalam membran sel atau harus di turunkan berat molekul nya terlebih dahulu? dan apakah uji Lipinski berpengaruh dengan berat molekul yang >500 Da?
Jadi suatu Berat molekul yang lebih dari 500 Da tidak dapat berdifusi menembus membrane sel. Semakin besar nilai log P, maka semakin hidrofobik molekul tersebut. Molekul yang memiliki sifat terlalu hidrofobik cenderung memiliki tingkat toksisitas yang tinggi karena akan tertahan lebih lama pada lipid bilayer dan terdistribusi lebih luas di dalam tubuh sehingga selektifitas ikatan terhadap enzim target menjadi berkurang Nilai log P yang terlalu negatif juga tidak baik karena jika molekul tersebut tidak dapat melewati membran lipid bilayer. Jumlah donor dan akseptor ikatan hidrogen mendeskripsikan semakin tinggi kapasitas ikatan hidrogen, maka semakin tinggi energi yang dibutuhkan agar proses absorpsi dapat terjadi. Secara umum aturan Lipinski menggambarkan solubilitas senyawa tertentu untuk menembus membran sel oleh difusi pasif . Jadi pada inti nya syarat molekul<500 Da dan harus di lakukan penurunan untuk melewati atau menebus membran sel.
Enzim COX-2 disini berinteraksi dengan reseptor lunacrin pada binding sitenya, membentuk ikatan hidrogen dengan residu asam amino Tyrosin 341. Bagaimanakah bentuk ikatan hidrogen yang terjadi dari interaksi enzim COX-2 dengan reseptor lunacrin? Mengapa bisa terbentuk ikatan hidrogen dari interaksi tersebut?
disebabkan karena ikatan hidrogen dapat terbentuk meskipun jarak antara ligand an reseptor cukup jauh. Hal ini berbeda dengan ikatan Van der Walls yang hanya terbentuk ketika jarak ligan dan reseptor berdekatan, Dan kenapa ikatan tersebut bisa interaksi disebabkan Ikatan hidrogen terjadi apabila atom H yang bersifat negatif berikatan dengan atom yang bersifat positif yaitu atom F, N, dan O.
Jadi, untuk menentukan sifat fisikokimia dari suatu ligan itu kan harus melakukan uji Lipinski dengan syarat berat molekul <500 Da, nah kalo berat molekul nya >500 Da itu sulit untuk menembus membran sel, nah bagaimana cara untuk menurunkan berat dari molekul tersebut, apakah molekul tersebut bisa tetap masuk kedalam membran sel atau harus di turunkan berat molekul nya terlebih dahulu? dan apakah uji Lipinski berpengaruh dengan berat molekul yang >500 Da?
BalasHapusJadi suatu Berat molekul yang lebih dari 500 Da tidak dapat berdifusi menembus membrane sel. Semakin besar nilai log P, maka semakin hidrofobik molekul tersebut. Molekul yang memiliki sifat terlalu hidrofobik cenderung memiliki tingkat toksisitas
Hapusyang tinggi karena akan tertahan lebih lama pada lipid bilayer dan terdistribusi lebih luas di dalam tubuh sehingga selektifitas ikatan terhadap enzim target menjadi berkurang Nilai log P yang terlalu negatif juga tidak baik karena jika molekul tersebut tidak dapat melewati membran lipid bilayer. Jumlah donor dan akseptor ikatan hidrogen
mendeskripsikan semakin tinggi kapasitas ikatan hidrogen, maka semakin tinggi energi yang dibutuhkan agar proses absorpsi dapat terjadi. Secara umum aturan Lipinski menggambarkan solubilitas senyawa tertentu untuk menembus membran sel oleh difusi pasif . Jadi pada inti nya syarat molekul<500 Da dan harus di lakukan penurunan untuk melewati atau menebus membran sel.
Enzim COX-2 disini berinteraksi dengan reseptor lunacrin pada binding sitenya, membentuk ikatan hidrogen dengan residu asam amino Tyrosin 341. Bagaimanakah bentuk ikatan hidrogen yang terjadi dari interaksi enzim COX-2 dengan reseptor lunacrin? Mengapa bisa terbentuk ikatan hidrogen dari interaksi tersebut?
BalasHapusdisebabkan karena ikatan hidrogen dapat terbentuk meskipun jarak antara ligand an reseptor cukup jauh. Hal ini berbeda dengan ikatan Van der Walls yang hanya terbentuk ketika jarak ligan dan reseptor berdekatan, Dan kenapa ikatan tersebut bisa interaksi disebabkan Ikatan hidrogen terjadi apabila atom H yang bersifat negatif berikatan dengan atom yang bersifat positif yaitu atom F, N, dan O.
Hapus